Zoals bijgaand organogram duidelijk maakt, bestaat het hoogste orgaan binnen de NVvP uit de ledenraad. Deze ledenraad bestaat uit 20 leden van de vereniging die democratisch zijn gekozen. De ledenraad bepaalt het strategisch beleid van de vereniging. Het verenigingsbestuur van de NVvP bestaat uit vijf psychiaters:

• prof. dr. R.J. van der Gaag, voorzitter
• drs. P.M.F.J.J. Knapen, vice voorzitter
• drs. J.A. van Waarde, penningmeester
• drs. V.M. Vladár Rivero, bestuurslid
• mw. dr. Th.J. Heeren, bestuurslid

Het Verenigingsbestuur is belast met het bestuur van de vereniging en is verantwoording schuldig aan de ledenraad. Het Verenigingsbestuur wordt over de verschillende dossiers geadviseerd door commissies. Deze commissies bestaan uit een diversiteit aan deskundigen op het beleidsterrein waar de commissie opereert. Zoals het organogram laat zien bestaan er negen commissies, te weten: Langdurige zorg, Accreditatie Bij- en Nascholing (ABNA), Psychotherapie, Commissie Wetenschappelijke Activiteiten (CWA), Kwaliteitszorg, Beroepsbelangen Commissie (BBC), Concilium, Raad Beroepscode/Intern tuchtreglement en TBS/BOPZ. Daarnaast kent de NVvP afdelingen en platforms, die ieder op hun werkterrein een signaleringsfunctie hebben en zorg dragen voor ontmoetingen en kennis uitwisseling tussen leden en/of geïnteresseerden. De afdelingen hebben daarnaast ten aanzien van segmentspecifieke aspecten een rol in de beleidsontwikkeling en uitvoering.